教育開発センターを運営するために小樽商科大学教育開発センター『運営委員会』を設置し，センターの管理運営に関する基本方針や予算及び教育支援経費の獲得に関すること，並びに学生論文賞に関する事項を審議します。
　この運営委員会のもとに以下の５つの部門を設置しています。



　学部教育開発部門
　 学部における教育課程の基本方針，教育内容・方法の改善，教員養成のあり方，ＦＤに関する事項等の業務を行います。

　大学院教育開発部門
　 大学院現代商学専攻における教育課程の基本方針，教育内容・方法の改善，教員養成のあり方，ＦＤに関する事項等の業務を行います。

　専門職大学院教育開発部門
　 専門職大学院であるアントレプレナーシップ専攻に関する体系的教育課程の編成及び実施体制，授業改善・教授法研究等の教育改善，事例研究・実地調査の実施，授業評価の実施と授業改善システム，ＦＤ研修に関する業務を行います。

　キャリア教育開発部門
　 キャリア教育及び就職支援に係る事業計画の策定並びに実施に関する業務を行います。

　研究部門
　 e-Learningシステムの研究・開発，e-Learningシステムの運用・改善，教育改善データベース，カリキュラム開発，教育評価法の開発，FD関連資料の調査・収集に関する業務を行います。